La obra Lasallana llegó a Ecuador el 28 de febrero de 1863, cuando el presidente García Moreno delegó al Hermano Yon José para establecer nuevas fundaciones educativas. Con plenos poderes para seleccionar locales y organizar los preparativos, el Hermano Yon José llegó a Loja en noviembre de 1870. Allí, inspeccionó la casa destinada a la Escuela de los Hermanos de las Escuelas Cristianas, realizó las observaciones necesarias y entregó una lista de los suministros indispensables.
El entusiasmo por abrir nuevas escuelas en la ciudad de Loja fue notablemente respaldado por el Dr. Manuel Eguiguren, Gobernador y patriota, quien se comprometió a preparar el edificio para el inicio del año escolar en agosto. Así, con gran alegría, la Escuela De la Salle en Loja se inauguró el 22 de octubre de 1871, comenzando con 210 alumnos en un edificio financiado por el legado del Dr. Bernardo Valdivieso. En sus inicios, las clases estaban muy concurridas: el Hermano León enseñaba a 100 alumnos en la «Gran Clase», el Hermano Benigno a 135 en la «Segunda», y el Hermano Calixto a 180 en la «Tercera».
Después de una ausencia de doce años, los Hermanos regresaron a Loja el 19 de septiembre de 1907, encabezados por el Hermano Visitador Imonís y acompañados por los Hermanos Viton Antonin, Génes Marie, Cirilo y Bernardo José. Monseñor José Antonio Eguiguren, el Obispo de Loja, apoyó su retorno.
El 21 de octubre de 1907 se reabrió la escuela con 300 alumnos. Con el tiempo, los Hermanos también se encargaron de la educación media en el Colegio “La Dolorosa” hasta la fundación del Colegio “La Salle” en 1963, gracias al apoyo del Congreso y otras instituciones, bajo la dirección del Hno. Rector Juan Nepomuceno (Luis Santander).
En 1964, las autoridades eclesiásticas solicitaron a los Hermanos de La Salle que asumieran la dirección del Colegio “La Dolorosa” tras el retiro de los Padres Lazaristas. Aceptaron y gestionaron el establecimiento durante algunos años.
En la actualidad, la Unidad Educativa Particular José Antonio Eguiguren – La Salle, es un Centro Educativo Particular-Católico ubicado en el sector centro-oriental de Loja, a orillas del río Zamora. La institución cuenta con 1684 alumnos, distribuidos en dos secciones: 1393 en la sección matutina y 291 en la sección vespertina.