La escuela vespertina San Juan Bautista De La Salle, surge como una obra social, hace 32 años, gracias a un grupo de profesores seglares comprometidos que integran la fraternidad SIGNUM FIDEI de Loja, organizados el 27 de noviembre del año 1987 y asesorados por el Hermano Luis Vinueza, Director de la Escuela José Antonio Eguiguren La Salle. Toman la decisión de crear una escuela Vespertina Gratuita, para dar una educación integral sobre todo cristiana a niños de escasos recursos económicos que no pueden asistir a ninguna escuela de la ciudad. Confiados en aquella providencia divina que estimula el esfuerzo noble y desinteresado, se hizo la gestión para utilizar las misma aulas de la escuela matutina, en ese entonces al Hermano Luis Lasso, Provincial del Instituto de La Salle. Una vez aceptado el proyecto los señores profesores  miembros  de la fraternidad Signum fidei, salen a visitar los barrios buscando las familias más pobres que tengan la edad escolar para inscribirlos inmediatamente.

La nueva escuela San Juan Bautista De La Salle, inició sus clases con el primer grado, el 24 de octubre de 1988, fecha de su creación, otorgada mediante decreto emitido por la Dirección Provincial Educación.

En esta obra se ve reflejado la fraternidad, la fe y el servicio, principios de nuestro Padre Fundador San Juan Bautista, el Señor De La Salle. El Primer Director de la escuela es el Sr. Giraldo Becerra, distinguido docente del establecimiento.

La Escuela San Juan Bautista De La Salle desde su creación hasta la actualidad no ha descuidado la formación cristiana y moral de los estudiantes, en este marco se dicta la asignatura de Educación Religiosa Escolar, mediante el departamento de Pastoral se desarrollan catequesis familiar, convivencias familiares, Primera Comunión y Confirmación.

Mediante oficio de fecha 30 de noviembre del 2011 en ese entonces el Director del establecimiento de la Escuela Particular “San Juan Bautista De La Salle” solicita a la Coordinación Zonal de Educación Zona 7 la FISCOMISIONALIZACIÓN del establecimiento, la misma que se encuentra regentada por la Congregación de los Hermanos de las Escuelas Cristianas, incorporándose a partir del año lectivo 2014-2015, cómo ESCUELA DE EDUCACIÓN BÁSICA FISCOMISIONAL SAN JUAN BAUTISTA DE LA SALLE, con la oferta educativa en el nivel de Educación General Básica de 1ro a 10mo grado; y, de conformidad a la malla curricular nacional.  

En la actualidad está regentada por la Mgs.  LADY KATHERINE ALVARADO VEINTIMILLA, Directora del establecimiento, con una planta docente especializada, contamos con 145 estudiantes, de primero a décimo grado de EGB, siendo su oferta educativa ordinaria, PREPARATORIA, BÁSICA ELEMENTAL, BÁSICA MEDIA Y BÁSICA SUPERIOR.

Cómo podemos apreciar desde aquellos años hasta la fecha la sociedad ecuatoriana y lojana ha sido la beneficiaria de la labor educativa católica cristiana, desarrollada por los Directivos y maestros lasallanos, cuya preocupación ha sido y es y será impartir a la niñez y juventud una educación integral, donde primen en especial los valores y principios éticos de la educación católica lasallista.